Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSEN2P49810 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSEN2P49810 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms