Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIM1P49642 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIM1P49642 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms