Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLMP48507 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCLMP48507 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCLMP48507 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCLMP48507 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLMP48507 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLMP48507 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLMP48507 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLMP48507 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLMP48507 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLMP48507 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLMP48507 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLMP48507 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLMP48507 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLMP48507 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLMP48507 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLMP48507 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GCLMP48507 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCLMP48507 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCLMP48507 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCLMP48507 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCLMP48507 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCLMP48507 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms