Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCLCP48506 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCLCP48506 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCLCP48506 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCLCP48506 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCLCP48506 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCLCP48506 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCLCP48506 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms