Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RECQLP46063 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RECQLP46063 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RECQLP46063 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RECQLP46063 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RECQLP46063 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RECQLP46063 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RECQLP46063 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RECQLP46063 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RECQLP46063 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RECQLP46063 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RECQLP46063 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RECQLP46063 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RECQLP46063 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RECQLP46063 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RECQLP46063 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RECQLP46063 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RECQLP46063 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RECQLP46063 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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