Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP5P45974 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP5P45974 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP5P45974 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP5P45974 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
USP5P45974 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP5P45974 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP5P45974 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP5P45974 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP5P45974 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP5P45974 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP5P45974 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP5P45974 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms