Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA4P43681 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA4P43681 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms