Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMPOP42166 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMPOP42166 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMPOP42166 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMPOP42166 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMPOP42166 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPOP42166 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPOP42166 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPOP42166 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPOP42166 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMPOP42166 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMPOP42166 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMPOP42166 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMPOP42166 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMPOP42166 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMPOP42166 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMPOP42166 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TMPOP42166 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMPOP42166 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TMPOP42166 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMPOP42166 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMPOP42166 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMPOP42166 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPOP42166 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPOP42166 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPOP42166 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPOP42166 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPOP42166 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPOP42166 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPOP42166 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMPOP42166 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMPOP42166 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMPOP42166 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms