Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN7P41732 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN7P41732 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms