Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5C1P36542 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5C1P36542 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms