Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHI3L1P36222 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms