Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPB2P35606 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPB2P35606 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPB2P35606 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPB2P35606 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPB2P35606 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPB2P35606 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPB2P35606 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms