Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSP1P33241 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSP1P33241 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSP1P33241 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSP1P33241 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSP1P33241 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSP1P33241 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSP1P33241 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSP1P33241 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSP1P33241 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSP1P33241 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSP1P33241 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSP1P33241 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSP1P33241 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSP1P33241 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSP1P33241 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSP1P33241 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSP1P33241 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSP1P33241 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSP1P33241 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms