Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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