Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA6P31267 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA6P31267 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA6P31267 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA6P31267 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA6P31267 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA6P31267 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA6P31267 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA6P31267 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA6P31267 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA6P31267 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA6P31267 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA6P31267 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA6P31267 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA6P31267 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA6P31267 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA6P31267 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms