Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms