Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL4A5P29400 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A5P29400 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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