Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SSFA2P28290 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms