Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA6P23229 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms