Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB5AP20339 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5AP20339 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms