Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B1P20020 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms