Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM21P19474 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM21P19474 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms