Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF30P17039 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF30P17039 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF30P17039 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF30P17039 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF30P17039 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF30P17039 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF30P17039 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms