Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB1P16220 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB1P16220 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB1P16220 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB1P16220 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB1P16220 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB1P16220 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB1P16220 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CREB1P16220 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CREB1P16220 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CREB1P16220 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB1P16220 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB1P16220 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB1P16220 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB1P16220 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB1P16220 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms