Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2F2P13984 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2F2P13984 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms