Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-EP13747 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms