Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG2P13521 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG2P13521 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG2P13521 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG2P13521 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG2P13521 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCG2P13521 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCG2P13521 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCG2P13521 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCG2P13521 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCG2P13521 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCG2P13521 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCG2P13521 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCG2P13521 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCG2P13521 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG2P13521 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms