Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC5P13010 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC5P13010 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms