Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI3P10071 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI3P10071 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI3P10071 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI3P10071 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI3P10071 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI3P10071 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI3P10071 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI3P10071 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI3P10071 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI3P10071 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI3P10071 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI3P10071 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI3P10071 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI3P10071 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
GLI3P10071 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI3P10071 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI3P10071 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI3P10071 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI3P10071 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI3P10071 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI3P10071 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI3P10071 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI3P10071 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI3P10071 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI3P10071 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI3P10071 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms