Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG8P0DPA2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG8P0DPA2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms