Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALM3P0DP25 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms