Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC192P0DO97 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms