Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2CP0DJJ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2CP0DJJ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms