Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PGA3P0DJD8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms