Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CT47B1P0C2W7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CT47B1P0C2W7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms