Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC175P0C221 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms