Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB7P09629 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms