Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VIL1P09327 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIL1P09327 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIL1P09327 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIL1P09327 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VIL1P09327 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VIL1P09327 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIL1P09327 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIL1P09327 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIL1P09327 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIL1P09327 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIL1P09327 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIL1P09327 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIL1P09327 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIL1P09327 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIL1P09327 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIL1P09327 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIL1P09327 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIL1P09327 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIL1P09327 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIL1P09327 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIL1P09327 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIL1P09327 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIL1P09327 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms