Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP10P09238 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP10P09238 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP10P09238 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP10P09238 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP10P09238 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP10P09238 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP10P09238 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP10P09238 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP10P09238 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP10P09238 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP10P09238 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MMP10P09238 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP10P09238 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP10P09238 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms