Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP3A4P08684 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP3A4P08684 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms