Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP3P08254 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP3P08254 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP3P08254 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP3P08254 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP3P08254 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP3P08254 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP3P08254 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP3P08254 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP3P08254 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP3P08254 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP3P08254 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP3P08254 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP3P08254 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP3P08254 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP3P08254 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP3P08254 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP3P08254 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP3P08254 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP3P08254 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP3P08254 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP3P08254 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP3P08254 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP3P08254 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP3P08254 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms