Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GLI1P08151 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GLI1P08151 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI1P08151 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI1P08151 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI1P08151 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI1P08151 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI1P08151 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI1P08151 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI1P08151 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI1P08151 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLI1P08151 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLI1P08151 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLI1P08151 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI1P08151 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms