Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NGFRP08138 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NGFRP08138 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NGFRP08138 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NGFRP08138 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NGFRP08138 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NGFRP08138 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NGFRP08138 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NGFRP08138 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NGFRP08138 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NGFRP08138 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NGFRP08138 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NGFRP08138 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NGFRP08138 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NGFRP08138 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NGFRP08138 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms