Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB1P08034 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB1P08034 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB1P08034 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB1P08034 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB1P08034 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB1P08034 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB1P08034 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms