Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPBP07199 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPBP07199 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CENPBP07199 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPBP07199 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPBP07199 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPBP07199 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPBP07199 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPBP07199 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPBP07199 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPBP07199 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPBP07199 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPBP07199 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPBP07199 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPBP07199 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPBP07199 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPBP07199 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPBP07199 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPBP07199 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPBP07199 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms