Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA4P06727 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA4P06727 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA4P06727 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA4P06727 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA4P06727 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA4P06727 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOA4P06727 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOA4P06727 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOA4P06727 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms