Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RB1P06400 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RB1P06400 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RB1P06400 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RB1P06400 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RB1P06400 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RB1P06400 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RB1P06400 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RB1P06400 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RB1P06400 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RB1P06400 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RB1P06400 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms