Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGGP02679 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGGP02679 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGGP02679 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGGP02679 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGGP02679 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGGP02679 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGGP02679 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGGP02679 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGGP02679 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGGP02679 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGGP02679 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms