Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOSP01100 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOSP01100 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOSP01100 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOSP01100 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOSP01100 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOSP01100 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSP01100 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSP01100 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSP01100 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms