Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
F2P00734 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
F2P00734 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F2P00734 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F2P00734 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F2P00734 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F2P00734 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F2P00734 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F2P00734 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F2P00734 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F2P00734 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F2P00734 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F2P00734 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F2P00734 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F2P00734 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F2P00734 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F2P00734 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F2P00734 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F2P00734 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F2P00734 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F2P00734 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F2P00734 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F2P00734 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F2P00734 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
F2P00734 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F2P00734 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F2P00734 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F2P00734 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F2P00734 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F2P00734 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F2P00734 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F2P00734 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F2P00734 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms